Τα αποτελέσματα της χρονιάς που πέρασε επηρεάστηκαν για την Proton Bank, σύμφωνα και με Ανακοίνωση της Εταιρείας, από Ζημιές του Εμπορικού Χαρτοφυλακίου λόγω των ιδιαίτερων συνθηκών που επικρατούν στις Αγορές διεθνώς, την Αποτίμηση από διακοπτόμενες δραστηριότητες (Proton Ασφαλιστική), την Απομείωση της Υπεραξίας (goodwill) από την Εξαγορά της Ωμέγα Τράπεζας και των Εταιρειών του Ομίλου της, αλλά και από τις σημαντικά υψηλότερες προβλέψεις.
Ειδικότερα, η Proton Bank για το 2008 εμφάνισε Ζημιές ύψους 61,8 εκατ. ευρώ, έναντι Κερδών 20,8 εκατ. ευρώ το 2007. Τα καθαρά Έσοδα από Τόκους διαμορφώθηκαν σε 42,6 εκατ. ευρώ το 2008, έναντι 43,3 εκατ. πέρυσι, σημειώνοντας οριακή μείωση κατά 1,6%, λόγω της δεδομένης συγκυρίας στη Χρηματαγορά και της επιβάρυνσης του κόστους χρήματος. Τα καθαρά έσοδα προμηθειών διαμορφώθηκαν σε 31,5 εκατ. ευρώ, έναντι 35,6 εκατ. πέρυσι, σημειώνοντας μείωση κατά 11,5%, αποτέλεσμα της υστέρησης των δραστηριοτήτων που σχετίζονται με την Επενδυτική Τραπεζική και παρά την αύξηση των προμηθειών που σχετίζονται με τις εργασίες στην Εμπορική Τραπεζική. Η πτωτική πορεία στις Κεφαλαιαγορές επιβάρυνε τα αποτελέσματα του εμπορικού χαρτοφυλακίου, το οποίο σημείωσε ζημιές ύψους 35,7 εκατ. ευρώ, έναντι κερδών 13,9 εκατ. το 2007. Το σύνολο των λειτουργικών εξόδων συγκρατήθηκε σε 56,4 εκατ. ευρώ, έναντι 57,2 εκατ. πέρυσι, σημειώνοντας μείωση κατά 1,4%. Τα αποτελέσματα της περιόδου επιβαρύνθηκαν επιπλέον κατά 11 εκατ. ευρώ λόγω της αποτίμησης της διακοπτόμενης δραστηριότητας βάσει της νέας συμφωνίας μεταβίβασης του 92,71% της Proton Ασφαλιστική στην εταιρεία Aspis Holdings. Τα κέρδη προ προβλέψεων και χρηματοοικονομικών αποτελεσμάτων χαρτοφυλακίων διαμορφώθηκαν σε 20 εκατ. ευρώ, έναντι 23 εκατ. το 2007, σημειώνοντας μείωση κατά 12,7%. Το σύνολο των Ιδίων Κεφαλαίων του Ομίλου διαμορφώθηκε σε 268 εκατ. ευρώ και ο δείκτης κεφαλαιακής επάρκειάς του στο 9,3%, ο οποίος αποτελείται μόνο από κύρια βασικά κεφάλαια (Core Tier I).